A gyors adatkezelés és megfelelő rendezettség kialakítása érdekében az adatállományok, un. indexállományokkal rendelkeznek. 
Az állományok újraindexelése alatt senki sem tartózkodhat a programban, ellenkező esetben az állományok újraindexelése egy figyelmeztető üzenettel leáll. A folyamatban lévő indexelés alatt más felhasználó sem tud belépni a rendszerbe. 

Az állományok újraindexelését két olyan esetben kell elvégezni, amikor a program újraindítása megtörténik:

• Frissítés betöltése után: az adatállományok esetleges bővítésének végrehajtása. A menüpontot minden programfrissítés betöltése után le kell futtatni, ellenkező esetben a program és az adatállományok eltérései miatt futási hibák keletkezhetnek („Variable not found” hibaüzenet). 

• Program lefagyása után: az indexállományok esetleges hibáinak kijavítása. Ha a számítógép vagy a program lefagyott, akkor a program újraindítása után az indexállományok megsérülhetnek. („Index file … is corrupted” vagy „… index tag not found” vagy „Invalid seek offset” hibaüzenetek). 

A törzsadatok rendezése opció során a közös állományokra (ügyfelek és jogok) fut le az újraindexelés. Az összes könyvelés összes évének megjelenítése opció során az ügyfelek összes könyvelési éve, az összes könyvelés utolsó évének megjelenítése opció során az ügyfelek utolsó könyvelési éveit jeleníti meg a listában.
A listában kiválasztható, hogy melyik ügyfél melyik könyvelési évét szeretnénk újraindexelni. A „Mindet kijelöli” gombbal az összes ügyfél összes könyvelési éve újraindexelésre kerül. A könyvelések egyesével, a „Space” billentyű lenyomásával vagy jobb egérgomb kattintással is kijelölhetők.  
Az „Adatbázis tömörítése” opció segítségével a logikailag törölt rekordok kerülnek végleges törlésre. Nem időrendben rögzített bizonylat kezelés esetén az adatbázis mérete a törölt rekordok miatt drasztikusan megnőhet. 
A „Mentés visszatöltése” (tudnivalók a Biztonsági mentés pontban) művelet után az állományok rendezése automatikusan lefut. A munkaállomásra másolt gyorsítótár adatok törlésre kerülnek (tudnivalók a Beállítások pontban).